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Dans le monde entier, l'étude systématique de nombreux gobies, présente un véritable défi pour les ichtyologues car ils présentent des multiples variations morphologiques dont les espèces de ce groupe englobent des formes cryptiques. Par ailleurs, les Gobiidae et les Gobionellidae présentent des caractères archaïques qui ont une importance particulière dans les études phylogénétiques et dans l'analyse évolutive. Et à Madagascar, ces animaux ne sont connus que par quelques informations superficielles et approximatives. Ces situations témoignent l'importance de soulever leur méconnaissance. Cette étude a pour but d'examiner certains aspects systématiques de quelques espèces de gobies. Les collectes des spécimens ont été menées en 2011 dans 35 sites par la pêche électrique. Soixante-six spécimens repartis en deux genres ont été examinés. L'analyse phylogénétique a montré que les spécimens étudiés appartiennent à huit espèces (4 existantes et 4 nouvelles). A l'état actuel des travaux de recherche, seule la différenciation morphologique des deux familles (ainsi qu'entre leurs espèces) est évidente. Mais les autres espèces restantes forment un groupe morphologiquement très proche.