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L'étude a montré que les bactéries accumulatrices du phosphore sont capables d'accumuler le phosphore en condition anoxique, en utilisant le nitrate comme accepteur d'électrons. La déphosphatation a été réalisée dans deux réacteurs séquentiels discontinus (RSD), en conditions aérobie et anoxique. Vingt neuf souches déphosphatantes et dénitrifiantes ont été isolées du RSD. L'étude de l'optimisation de la déphosphatation anoxique dans le RSD A2 a été réalisée en deuxième partie de ce travail. Elle a révélé que la performance était maximale à un âge de boues de 15 jours, à une concentration de 120 mg.l-1 de N-NO3 apportée au réacteur en phase anoxique et à un rapport d'alimentation P/C de 20/100. En fin d'étude, nous avons mis en place un procédé original intégrant l'élimination du carbone, de l'azote et du phosphore, par couplage d'un réacteur de déphosphatation anoxique avec un réacteur à lit fixe de nitrification. Le procédé a été validé sur des effluents d'abattoir. Il a montré une excellente performance d'épuration. Une élimination totale du phosphore a été observée. Les taux d'élimination de la DCO et de l'azote ammoniacal ont atteint respectivement 100% et 85%.