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Le Burundi est doté d'une grande richesse en écosystèmes naturels ainsi qu'en biodiversité végétale et animale, principalement en raison de la diversité des conditions écologiques. Il est divisé en 11 régions naturelles qui peuvent être regroupées en cinq zones écologiques: la plaine de l'Imbo à l'Ouest; la crête Congo-Nil; les hauts plateaux centraux; la dépression du Moso à l'Est, les escarpements de Mumirwa et la dépression du Bugesera au Nord-Est.